科技是生产力，科学技术工作是我州历届党委、政府高度重视的重要工作之一，在坚持“经济建设必须依靠科学技术，科学技术工作必须面向经济建设”方针的同时，围绕全州经济发展思路和工作重点，全面实施“科教兴州”战略，促进各项事业较快发展，科技对经济、社会发展的贡献率达到40%，全民科技素质有了较大提高，农牧业产业化、工业技术创新得到有效提升，旅游、环保建设速度加快，2005年通过四川省人民政府对2003-2004年度市（州）、县科技进步综合考核，阿坝州被评为科技工作先进市（州），
2006年州委、州政府在坚持实施“科教兴州”战略的同时，作出了《关于加快科技进步，建设创新型阿坝的决定》，全州各族人民正朝着新的目标，向“十一五”科技发展规划迈进，努力实现新的跨越，科技进步成效显著。

　　——科技投入力度加大，“十五”期间科技投入1315.7万元，实施科技专项205个，其中，争取国家、省科技项目36 项。获的科技成果44项，其中，获得省级以上科技成果12项。

　　——知识产权工作有新突破，专利申请168项，其中获授权127项。实施专利成果转化42项，新增产值7321万元，新增利税1081万元。

　　——科技力量明显壮大，全州科技人员总数达到20913人，从事研究、开发、服务的各类专业技术人员达14000余人，其中：拥有高级技术职称的610人、较“九五”增加264人，中级5082人。

　　——推进科研机构改革，将原分属于各主管部门的农科所、畜科所、林科所、信息所、农牧机械研究所合并组建成阿坝州科学技术研究院。有效的整合了科技研究机构，形成了整体活力。

　　——科技投入力度逐年加大，“十五”期间州本级财政投入科技应用研究与开发资金共计849.7万元，比“九五” 期间的372万元增加477.7万元。争取国家、省科技项目资金429.5万元。

　　——农牧业科技产业逐步推进，小麦、玉米、青稞、豆类、蔬菜、水果等优良新品种大面积推广，良种覆盖面达91%。种草养、畜种改良、牛、羊、猪快速育肥等技术试验示范推广成效显著，农畜产品深加工得到进一步开发，牦牛骨综合利用开发项目取得新突破，研制成功“牦牛多肽骨素”、“牦牛运动蛋白”新产品，并建成生产线正式投产。

　　——工业技术创新格局雏形，认定省高新技术企业1家、省民营科技企业4家、省专利试点企业1家、州民营科技企业15家、州专利试点企业5家。申请国家、省创新基金（资金）项目2项。开发的特种复合合金——“稀土硅铁”、“稀土硅锆”等新产品形成产业化生产。

　　——中药科技产业步伐加快，引进、培育中药材种植加工企业14家，建立了川贝母、红豆杉、九寨刀党等基地3万余亩；建立人工养麝基地2个，人工养麝1300余只。藏羌民族药业研发取得新成果，藏药三类新药“亚玛众青胶囊”获的国家二期临床批文，藏药新制剂—“夏萨德西丸”、羌药新药—“萨族布口服液”（健血宝口服液）进入前期临床研究。

　　——积极开展生态治理，针对我州干旱河谷、草原退化、草地沙化的问题实施了退化生态系统恢复与重建、退化草原治理技术示范、沙化治理技术研究。针对不同生态系统特点和生态退化的关键问题以提高植被覆盖率减少水土流失为总目标，通过新技术创新对已有技术的集成、组装、配套建立起具有显著生态恢复示范区。引进澳大利亚辐射松树种造林3万余亩、退化草原治理5万余亩，草地沙化治理6千余亩。

　　——科技交流与合作进一步加强，先后与澳大利亚，芬兰、俄罗斯、美国、香港、澳门等国家和地区及国内有关科研院所、大中专院校开展了多方面交流与合作，为我州经济建设发挥了重要作用。